Shinichi Kudo è un brillante investigatore che, nonostante i suoi soli diciassette anni, aiuta la polizia a risolvere i casi più misteriosi e difficili. Un giorno assiste a un omicidio, a opera di misteriosi uomini in nero che, accortisi della sua presenza, decidono di ucciderlo con un farmaco sconosciuto. Il risultato, tuttavia, non è quello sperato e Shinichi rimane in vita, venendo però trasformato in un bambino delle elementari. Dopo aver chiesto aiuto al suo vicino di casa, il professor Agasa, Shinichi decide di tenere segreta la sua vera identità e ispirato dai suoi scrittori di gialli preferiti (lo scozzese Arthur Conan Doyle e il giapponese Ranpo Edogawa) il ragazzo sceglie di cambiare nome in Conan Edogawa e andare a vivere in incognito dall’ignara fidanzata Ran, figlia del detective incapace Kogoro Mori. Da quel momento Shinichi, mentre indaga sulla misteriosa organizzazione degli uomini in nero, risolve un gran numero di casi in cui si imbattono Kogoro e la polizia. Utilizzando un anestetico, nascosto in uno speciale orologio, per addormentare Kogoro e un modulatore a forma di papillon per imitarne la voce, Conan spiega ai presenti la soluzione, senza far capire chi lui sia realmente. Riuscirà così Conan, caso dopo caso, a ritornare adulto?
